蛋白質名稱混淆引發抗體誤用 影響300多篇論文
Protein name confusion created antibody mix-up affecting hundreds of papers
5 JUN 2026 12:00 PM ETBYMITCH LESLIE
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數百名研究癌症和衰老的科學家犯下了一個本可輕易避免卻極其嚴重的錯誤,他們使用了錯誤的抗體來檢測一種關鍵蛋白質,這項發現來自一位專門揭露生物醫學文獻錯誤的研究人員。這些研究人員本該使用能識別抑癌蛋白質p16INK4a(該蛋白質可能也會促進衰老)的抗體,卻誤用了針對名稱相似的蛋白質p16-ARC的抗體,而p16-ARC有助於構建細胞的分子骨架。
此錯誤出現在300多篇論文中,包括發表於《自然》、《自然醫學》、《癌症細胞》、eLife和《科學先進》等頂級期刊的部分文章。英國生物技術公司OXB的分子生物學家、兼職錯誤偵查員夏洛特·大衛(Sholto David)在報告中指出,他於6月2日發布在「更好科學」部落格的最新發現,已促使研究人員翻閱舊實驗筆記,甚至至少有一次案例中,他們回到實驗室重新進行實驗。
科學家們表示,對於未被列入過錯名單的論文作者而言,這個失誤令人尷尬且對部分結果提出質疑。「這不會改變我們對p16作用的認知,」俄亥俄州立大學分子遺傳學家克莉絲汀·柏德(Christin Burd)說道。但「紀錄需要一些修正。」
抗體是實用的實驗室工具,因為這些免疫蛋白質能與特定目標結合。聖裘德兒童研究醫院癌症生物學家查爾斯·謝爾(Charles Sherr)表示,用於識別p16INK4a的抗體(研究人員可能用來定位產生該蛋白質的細胞)「在數千項癌症和衰老研究中發揮了重要作用」。該蛋白質屬於一條阻斷細胞週期的途徑——細胞週期是一系列準備細胞分裂的事件,因此抑制腫瘤生長。p16INK4a也會促使細胞進入被稱為衰老的不分裂狀態,這可能導致衰老過程中的組織退化。
其基因具有雙重功能,還會編碼另一種名為ARF的蛋白質。因此,部分識別p16INK4a的抗體也可能結合ARF,導致結果誤導。研究人員早已知曉此問題數年,但大衛指出了一個不同問題。
大衛以揭露錯誤(包括不當行為)聞名。他最近發現抗體銷售商賽默飛世爾科技(Thermo Fisher Scientific)發布的數據存在問題。去年,他因依據《虚假申報法》提出訴訟,證明該機構研究人員的論文包含可疑圖像和數據,而從丹娜法伯癌症研究院獲賠263萬美元。
他在研究一些據稱能產生p16INK4a、卻已知缺乏該蛋白質基因的癌症細胞株時,意外發現這項新錯誤。當他在抗體製造商Abcam官網輸入「p16」時,第一個跳出的項目即是針對p16-ARC的抗體。其他公司也同時提供兩種抗體。大衛懷疑其他研究人員是否也和他最初一樣混淆,最終訂購了錯誤產品。
隨後,他核對了334篇關於p16INK4a或p16-ARC研究的抗體產品編號,以確認研究人員是否使用正確抗體。在312項研究中,研究人員使用了p16-ARC抗體來探測p16INK4a。最早期的論文可追溯至十多年前,大衛表示:「這顯示生物學研究流程存在某種問題,才能讓錯誤長達如此久都無人察覺。」
大衛在貼文中承認,某些案例中,團隊可能實際使用了正確抗體,卻在論文中標註錯誤。這正是他標記的最顯著研究之一所發生的情況:索爾克生物研究所分子生物學家揚·卡爾塞德(Jan Karlseder)及其同事2019年發表於《自然》的論文,探討了不涉及衰老機制的清除癌前細胞途徑。研究人員需要該抗體來測試細胞是否產生p16INK4a。卡爾塞德表示,翻閱實驗記錄後,團隊確認訂購了正確抗體——他還有銷售商的收據證明。但團隊在投稿論文的方法部分填寫了錯誤產品編號。他表示,卡爾塞德與同事已向《自然》提交更正。
牛津大學幹細胞生物學家西蒙·里德姆(Simon Leedham)2015年發表於《自然醫學》、探討大腸癌起源的論文也在大衛的名單中。他承認團隊同時使用了兩種抗體,目前正用僅含p16INK4a抗體重複相關實驗以確保結果正確。但里德姆表示,他和同事擁有其他支持結論的證據。
大衛指出,令人憂慮的是,使用錯誤抗體的研究人員有時報告的結果,唯有在使用正確抗體的情況下才合理。謝爾也對此行為感到不安。「這證明……人們有能力基於有缺陷的數據杜撰故事。」
大衛表示,部分研究團隊可能涉及欺詐——在他指出抗體問題前,至少有四篇論文已被撤回。他在貼文中寫道,其他團隊可能犯下「選擇性報告、寫作錯誤,以及……在未進一步質疑或探索的情況下,盲目發表矛盾發現」的過失。
「我能理解此命名法可能造成大量混淆,」舊金山加州大學老化學家蒂恩·彭(Tien Peng)表示。但稍加謹慎即可幫助研究人員避免錯誤。例如,若他們運行陰性對照實驗,測試缺乏p16INK4a的細胞,就會發現異常,柏德說道。此外,彭強調,科學家應知曉不能單靠p16INK4a抗體檢測衰老細胞。「衰老沒有單一標記物。」
謝爾指出,儘管混淆的術語可能是問題根源,但現在修改蛋白質名稱已太遲——它們已在文獻中確立。柏德表示,忙碌的審稿人無法檢查論文中的每個產品編號。但她認為期刊可以協助,例如標記提及問題抗體的投稿,讓審稿人核查作者是否做出正確選擇。
謝爾總結道,大衛揭露這些錯誤對該領域或有益處。「我看不出這問題如何能輕易修正,除非讓犯錯者感到尷尬。」